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【广东会GDH基因检测】如何将肿瘤基因检测的研究结果快速应用到临床

随着生物医学技术的不断进步,肿瘤基因检测与精准治疗逐渐成为肿瘤治疗领域的重要组成部分。基因检测能够识别肿瘤的分子特征,为医生制定个性化治疗方案提供依据。尽管当前有多种基因检测技术和生物标志物可供选择,但其在临床实践中的应用仍处于不断发展和完善之中。本文将探讨肿瘤基因检测的现状、相关技术及其在精准治疗中的重要性,分析研究与临床实践之间的

广东会GDH基因检测】如何将肿瘤基因检测的研究结果快速应用到临床


肿瘤基因检测导读:

随着生物医学技术的不断进步,肿瘤基因检测与精准治疗逐渐成为肿瘤治疗领域的重要组成部分。基因检测能够识别肿瘤的分子特征,为医生制定个性化治疗方案提供依据。尽管当前有多种基因检测技术和生物标志物可供选择,但其在临床实践中的应用仍处于不断发展和完善之中。本文将探讨肿瘤基因检测的现状、相关技术及其在精准治疗中的重要性,分析研究与临床实践之间的“灰色地带”,并展望未来的发展方向。

肿瘤基因检测的基础

肿瘤基因检测是指通过检测肿瘤细胞中的基因突变、基因表达和其他遗传特征,以评估肿瘤的生物学行为和预后。基因检测可以帮助医生选择合适的治疗方案,提高治疗效果。

1. 主要的基因检测方法

a. 单基因检测

单基因检测是指对特定基因进行检测,以确定其突变状态。例如,在结直肠癌患者中,KRAS基因的突变状态可以指导抗EGFR治疗的选择。这类检测较为简单,适用于明确已知的生物标志物。

b. 多基因检测

随着高通量测序技术的发展,多基因检测(如NGS)逐渐成为主流。多基因检测可以同时评估多个基因的突变状态,为患者提供更全面的信息。这种检测适合于复杂的肿瘤类型,能够发现潜在的治疗靶点。

c. 全基因组测序

全基因组测序(WGS)是对整个基因组进行测序,能够识别所有可能的遗传变异。这种技术虽然成本较高,但为肿瘤的深入研究提供了丰富的数据。

2. 主要生物标志物的应用

在肿瘤的基因检测中,一些生物标志物已经成为临床实践的标准。以下是几个关键的生物标志物及其应用:

a. KRAS基因

在结直肠癌患者中,KRAS基因的突变与抗EGFR疗法(如西妥昔单抗和帕尼单抗)的疗效相关。对KRAS突变的检测已经成为临床指南推荐的标准。

b. HER2基因

乳腺癌中,HER2基因的表达水平与抗HER2靶向治疗(如曲妥珠单抗和拉帕替尼)的应用密切相关。HER2检测的普遍采用标志着精准治疗的一个重要里程碑。

c. PD-L1表达

PD-L1的表达水平是判断免疫检查点抑制剂(如纳武单抗和帕博利珠单抗)疗效的关键因素。高PD-L1表达通常预示着更好的治疗反应。

前沿研究与临床实践之间的灰色地带

尽管肿瘤基因检测技术已经取得了显著进展,但在临床应用中仍然存在许多挑战,主要体现在以下几个方面:

1. 标记物的标准化与验证

目前,许多基因标记物仍处于“研究”阶段,尚未获得临床使用的广泛认可。例如,尽管有专家共识认为某些基因标记物具有可操作性,但国家综合癌症网络(NCCN)尚未推荐这些基因的普遍检测。这种状态使得研究与临床实践之间的转化面临困难。

2. 成本效益比的争论

随着基因检测技术的发展,检测成本逐渐降低。然而,如何评估广泛基因检测的成本效益比仍是一个有争议的话题。虽然高通量测序能够提供大量信息,但其实际应用价值仍需通过更多的临床试验进行验证。

3. 数据解读与临床决策

基因检测结果的解读通常需要专业的知识,许多临床医生可能对复杂的基因组信息感到困惑。此外,某些标记物的临床意义尚不明确,如何将基因检测结果有效地转化为治疗决策仍然是一个挑战。

 

广东会GDH基因检测的优势

尽管当前肿瘤基因检测与精准治疗面临诸多挑战,但随着科技的进步与临床研究的不断深入,未来的发展前景依然广阔。

1. 扩大基因检测的应用范围

广东会GDH基因检测致力于扩大基因检测的适用范围,探索更多潜在的生物标志物,以提升治疗的有效性。例如,研究人员正在积极寻找新的驱动基因和突变,以指导靶向治疗。

2. 增强数据共享与合作

为了加速基因检测结果的临床应用,促进数据共享与国际合作至关重要。通过建立统一的数据共享平台,研究人员和临床医生可以更有效地交流和验证检测结果,提高研究的有效性。

3. 实施个体化治疗策略

随着对肿瘤分子机制的深入理解,个体化治疗策略将成为未来治疗的主流。这要求将患者的基因检测结果与其临床表现、生活方式等信息结合起来,为患者制定量身定制的治疗方案。

4. 进行更大规模的临床试验

当前许多基因检测仍缺乏大规模的临床试验证据。未来的研究需要加强多中心、大规模的临床试验,以验证新标记物和靶向治疗的临床效益,为临床实践提供坚实的数据基础。

肿瘤基因检测的共识性结论

肿瘤基因检测与精准治疗正在为癌症治疗带来深远的变革。尽管在研究与临床实践之间仍存在一些挑战,但通过标准化检测、优化数据共享和推动个体化治疗的发展,我们有望在不久的将来实现更高效的癌症治疗。随着科学技术的进步和临床研究的深入,肿瘤基因检测的未来将充满希望,为更多患者带来福音。

根据《人体肿瘤及其基因序列变化》,不同肿瘤的临床医学基因检测位点

NSCLC 肛门癌 结直肠癌
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
MSI NGS 10 1893 0.5 TML NGS 6 91 33.0 KRAS NGS 1744 3427 50.9
TML NGS 712 4557 15.6 PD‐L1 IHC 63 191 33.0 NRAS NGS 146 3427 4.3
PD‐L1 (22c3) IHC 2541 5658 44.9 PIK3CA NGS 22 92 33.0 BRAF NGS 285 3427 8.3
ALK IHC 10 4606 0.2 TP53 NGS 10 92 33.0 PIK3CA NGS 600 3427 17.5
MET NGS 84 4606 1.8 MSI NGS 0 40 0.0 POLE NGS 14 3424 0.4
MET CNV 84 4606 1.8 腹膜癌 RSPO3 Fusion 32 1272 2.5
MET Fusion 84 4606 1.8 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 MLH1 IHC 5840 6132 95.2
ALK ISH/fusion 10 4606 0.2 KRAS NGS 42 87 48.3 PMS2 IHC 5719 6097 93.8
ALK NGS 10 4606 0.2 GNAS NGS 24 87 27.6 MSH2 IHC 6011 6121 98.2
RET Fusion 19 4164 0.5 SMAD4 NGS 10 87 11.5 MSH6 IHC 5947 6104 97.4
ROS1 Fusion 14 4186 0.3 ATM NGS 2 87 2.3 MSI NGS 83 1346 6.2
RET Fusion 19 4164 0.5 BRAF NGS 4 87 4.6 TML NGS 247 3400 7.3
PTEN IHC 7792 12,618 61.8 NRAS NGS 1 87 1.1 HER2 IHC 161 8708 1.8
BRAF NGS 165 4606 3.6 PIK3CA NGS 3 87 3.4 HER2 CISH 129 4460 2.9
EGFR (L858R) NGS 174 4659 3.7 MLH1 IHC 190 192 99.0 PD‐L1 IHC 196 6405 3.1
EGFR (exon 19 del) NGS 260 4659 5.6 PMS2 IHC 189 192 98.4 PTEN IHC 5334 11,407 46.8
EGFR T790M NGS 62 4773 1.3 MSH2 IHC 189 192 98.4 小肠癌
EGFR tertiary NGS 3 4659 0.1 MSH6 IHC 187 192 97.4 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
ERBB2 NGS 70 4606 1.5 MSI NGS 1 27 3.7 KRAS NGS 100 183 54.6
KRAS NGS 1319 4606 28.6 TML NGS 1 87 1.1 NRAS NGS 3 183 1.6
NTRK1/2/3 Fusion 3 3797 0.1 PD‐L1 (SP142) IHC 7 211 3.3 BRAF NGS 14 183 7.7
NTRK IHC 35 2031 1.7 PTEN IHC 252 393 64.1 PIK3CA NGS 26 183 14.2
PIK3CA NGS 219 4606 4.8   POLE NGS 1 183 0.5
DDR2 NGS 0 4606 0.0 MLH1 IHC 88 96 91.7
AKT1 NGS 9 4761 0.2 MSH2 IHC 90 96 93.8
小细胞肺癌 MSH6 IHC 89 96 92.7
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 PMS2 IHC 89 96 92.7
MSI NGS 0 88 0.0 MSI NGS 10 71 14.1
TML NGS 13 205 6.3 TML NGS 18 182 9.9
PD‐L1 IHC 182 206 88.3 HER2 IHC 10 482 2.1
TP53 NGS 99 205 48.3 HER2 CISH 11 269 4.1
RB1 NGS 11 206 5.3 PD‐L1 IHC 25 342 7.3
NOTCH1 NGS 0 206 0.0 PTEN IHC 264 526 50.2
RET NGS 0 206 0.0 RSPO3 Fusion 6 57 10.5
SMO NGS 0 49 0.0  
胃食管癌 胆管癌 膀胱癌
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
ATM NGS 31 922 3.4 IDH1 NGS 39 474 8.2 MSI NGS 4 152 2.6
BLM NGS 5 921 0.5 IDH2 NGS 14 474 3.0 TML NGS 58 361 16.1
CDH1 NGS 50 921 5.4 BAP1 NGS 35 474 7.4 ATM NGS 21 364 5.8
MLH1 NGS 6 922 0.7 PBRM1 NGS 23 474 4.9 BRCA1 NGS 12 364 3.3
MSH2 NGS 3 921 0.3 KRAS NGS 82 474 17.3 BRCA2 NGS 17 364 4.7
MSH6 NGS 15 921 1.6 NRAS NGS 16 474 3.4 ERCC2 NGS 0 364 0.0
PMS2 NGS 2 921 0.2 BRAF NGS 13 474 2.7 FANCC NGS 0 364 0.0
SMAD4 NGS 44 921 4.8 PIK3CA NGS 30 474 6.3 FGFR3 NGS 43 364 11.8
BMPR1A NGS 7 921 0.8 MLH1 IHC 70 73 95.9 RB1 NGS 55 364 15.1
TP53 NGS 686 922 74.4 PMS2 IHC 69 73 94.5 TSC1 NGS 23 364 6.3
PTEN NGS 30 922 3.3 MSH2 IHC 72 73 98.6 PD‐L1 IHC 162 788 20.6
APC NGS 58 922 6.3 MSH6 IHC 72 73 98.6 PROSTATE CANCER
STK11 NGS 17 921 1.8 MSI NGS 1 177 0.6 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
PD‐L1 IHC 180 1804 10.0 TML NGS 15 469 3.2 MSI NGS 6 151 4.0
MSI NGS 15 389 3.9 HER2/neu IHC 40 1301 3.1 TML NGS 15 416 3.6
TML NGS 47 916 5.1 HER2 CISH 38 618 6.1 ATM NGS 22 422 5.2
HER2 IHC 75 1431 5.2 PD‐L1 IHC 78 934 8.4 BRCA1 NGS 6 365 1.6
HER2 CISH 168 1323 12.7 BRAF Fusion 2 131 0.0 BRCA2 NGS 26 365 7.1
PIK3CA NGS 34 462 7.4 FGFR3 Fusion 1 149 0.7 AR NGS 35 440 8.0
CDKN2A NGS 78 922 8.5 FGFR2 Fusion 7 149 4.7 PD‐L1 IHC 25 811 3.1
胰腺癌 肝细胞癌 AR IHC 1127 1213 92.9
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 TMPS:ERG2 Fusion 57 198 28.8
MSI NGS 6 456 1.3 CTNNB1 NGS 53 166 31.9  
TML NGS 18 1149 1.6 TP53 NGS 56 166 33.7
KRAS NGS 942 1164 80.9 ARID1A NGS 8 166 4.8
NRAS NGS 2 1164 0.2 MSI NGS 1 69 1.4
BRAF NGS 18 1164 1.5 TML NGS 4 166 2.4
CDKN2A NGS 229 1164 19.7 PD‐L1 IHC 26 366 7.1
HER2 IHC 38 2096 1.8  
HER2 ISH 26 4063 0.6
PD‐L1 IHC 222 2682 8.3
ATM NGS 42 1164 3.6
BRCA1 NGS 13 1031 1.3
BRCA2 NGS 36 1031 3.5
肾癌 子宫内膜癌 乳腺癌 (继续)
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
MSI NGS 1 107 0.9 TML NGS 282 1469 19.2 BRCA1 NGS 59 1960 3.0
TML NGS 3 327 0.9 MSI NGS 163 796 20.5 BRCA2 NGS 88 1960 4.5
BAP1 NGS 33 333 9.9 MSI Frag analysis 267 1831 14.6 CDH1 NGS 160 2164 7.4
FH NGS 2 332 0.6 POLE NGS 42 1841 2.3 CHEK2 NGS 32 2169 1.5
FLCN NGS 1 332 0.3 PTEN NGS 1137 1843 61.7 ESR1 NGS 159 2164 7.3
MET NGS 6 333 1.8 PIK3CA NGS 823 1843 44.7 FLCN NGS 3 2164 0.1
PBRM1 NGS 60 332 18.1 ARID1A NGS 745 1841 40.5 NBN NGS 4 2164 0.2
SDHD NGS 0 332 0.0 HER2 (ERBB2) NGS 21 1843 1.1 NF1 NGS 86 2169 4
SETD2 NGS 46 332 13.9 HER2 (ERBB2) CNV 61 1867 3.3 PALB2 NGS 27 2164 1.2
TSC1 NGS 5 332 1.5 MSH6 IHC 2273 2295 99 PTEN NGS 143 2169 6.6
TSC2 NGS 2 332 0.6 MSH2 IHC 2301 2306 99.8 STK11 NGS 15 2164 0.7
VHL NGS 153 333 45.9 PMS2* IHC 1887 2293 82.3 TP53 NGS 1203 2169 55.5
PD‐L1 IHC 117 630 18.6 MLH1* IHC 1912 2298 83.2 GLIOBLASTOMA
卵巢癌 PD‐L1 IHC 460 4502 10.2 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 宫颈癌 IDH1 NGS 161 851 18.9
MSI NGS 23 1484 1.5 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 IDH2 NGS 3 851 0.4
TML NGS 63 3434 1.8 MSI NGS 2 116 1.7 BRAF NGS 17 851 2.0
BRCA1 NGS 238 2924 8.1 TML NGS 20 305 6.6 MSI NGS 1 265 0.4
BRCA2 NGS 180 2922 6.2 TP53 NGS 56 307 18.2 TML NGS 28 847 3.3
ATM NGS 63 3463 1.8 PIK3CA NGS 92 307 30.0 ATRX NGS 59 851 6.9
PIK3CA NGS 290 3463 8.4 PD‐L1 IHC 191 802 23.8 CIC NGS 18 851 2.1
PTEN NGS 158 3463 4.6 BREAST CANCER FUBP1 NGS 8 851 0.9
KRAS NGS 253 3463 7.3 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 MGMT Methylation 828 1773 46.7
NF1 NGS 170 3463 4.9 MSI NGS 5 779 0.6 1p19q FISH 52 779 6.7
ARID1A NGS 279 3458 8.1 TML NGS 76 2146 3.5.0 EGFRvIII Fusion 87 630 13.8
SMARC4A NGS 19 3452 0.6 PD‐L1 IHC 389 5519 7 EGFR CNV 257 828 31
ER IHC 7947 16,384 48.5 AR IHC 5698 11,114 51.3 PD‐L1 IHC 209 1346 15.5
PR IHC 4698 16,353 28.7 ER IHC 5598 9404 59.5 NTRK Fusion 8 404 2.0
PD‐L1 IHC 748 8693 8.6 PR IHC 3806 9362 40.7 MET Fusion 11 404 2.7
  HER2 IHC 900 9299 9.7 EGFR Fusion 3 404 0.7
HER2 CISH 726 6087 11.9 FGFR3 Fusion 12 404 3.0
ATM NGS 50 2169 2.3 BRAF Fusion 2 404 0.5
  PDGFRA Fusion 1 404 0.2
肉瘤 黑色素瘤 葡萄膜黑色素瘤
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比 检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
MSI NGS 6 350 1.7 MSI NGS 0 293 0.0 MSI NGS 0 22 0.0
TML NGS 32 1025 3.1 TML NGS 289 774 37.0 TML NGS 3 97 3.1
RB1 NGS 63 1034 6.1 BRAF NGS 313 782 40.0 BAP1 NGS 49 99 49.5
NF1 NGS 51 1036 4.9 KIT NGS 20 801 2.0 GNA11 NGS 43 99 43.4
KIT NGS 1 601 0.2 MEK1 NGS 27 782 4.0 GNAQ NGS 48 99 48.5
PDGFRA NGS 0 1036 0.0 NF1 NGS 189 782 24.0 SF3B1 NGS 11 99 11.1
EWSR1 Fusion 3 28 10.7 NRAS NGS 197 782 25.0 PD‐L1 IHC 21 139 15.1
RET Fusion 1 469 0.2 CDKN2A NGS 111 782 14.0  
ALK Fusion 3 470 0.6 PTEN NGS 47 782 6.0
NTRK1 Fusion 1 469 0.2 MDM2 CNV 16 749 2.0
RAF1 Fusion 1 28 3.6 PD‐L1 IHC 452 1381 33.0
PD‐L1 IHC 505 2386 21.2  
HNSCC头颈部鳞状细胞癌
检测位点 检测技术 阳性样本数量 全部样本数量 占比
MSI NGS 1 164 0.6
TML NGS 24 324 7.4
TP53 NGS 201 326 61.7
PIK3CA NGS 43 326 13.2
PD‐1 IHC 250 340 73.5
PD‐L1 IHC 255 721 35.4

缩写:AR,雄激素受体;CISH,显色原位杂交;CNV,拷贝数变异;del,缺失;ER,雌激素受体;FISH,荧光原位杂交;Frag分析,片段分析;HNSCC,头颈部鳞状细胞癌;IHC,免疫组织化学;ISH,原位杂交;MSI,微卫星不稳定性;NGS,下一代测序;NSCLC,非小细胞肺癌;PD-1,程序性细胞死亡蛋白1;PD-L1,程序性死亡配体1;PR,孕酮受体;TML,肿瘤突变负荷。


(责任编辑:广东会GDH基因)
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